港区の人工島ポートアイランドにある月光館学園高等部に編入した主人公の少年は、怪物の襲撃をきっかけに「ペルソナ」という心の力に目覚める。
彼は特別課外活動部（S.E.E.S.）に加入し、仲間と共に「影時間」に現れる謎の怪物「シャドウ」を討伐するため戦い続ける。
果たして彼を待ち受ける運命とは…
男性主人公
アルカナ – 愚者（ワイルド）
ペルソナ – オルフェウス
武器 – 片手剣
男性 / 生年月日 – 1992年 / 星座 – 不明 / 身長 – 不明 / 体重 – 不明 / 血液型 – 不明
本作の男性主人公。17歳。月光館学園に転入してきた高校2年生の少年。10年前に「シャドウ」研究所の爆発事故で両親を亡くし、それ以来各地を転々としている。
岳羽 ゆかり（たけば ゆかり）
アルカナ – 恋愛
ペルソナ – イオ
武器 – 弓
女性 / 生年月日 – 1992年10月19日 / 星座 – 天秤座 / 身長 – 159cm / 体重 – 不明 / 血液型 – B型
茶色のショートヘアにハートのチョーカーが特徴の主人公のクラスメイトの女子。16歳。弓道部に所属する。
伊織 順平（いおり じゅんぺい）
アルカナ – 魔術師
ペルソナ – ヘルメス
武器 – 両手剣
男性 / 生年月
